依托北京航空航天大学在国内顶尖的计算机学科、电子信息工程及相关学科优势，软件学院于2002年4月正式成立，是教育部、国家计委批准的35所国家示范性软件学院之一，现担任全国软件工程领域工程硕士培养工作牵头单位。软件学院通过吸引众多来自世界各国的优秀资深工程师和学者，将其多年的市场经验、学术研究和业界发展动向融入教学，实现企业需求与人才培养的紧密结合，培养国际化、实用化的软件工程技术人才和管理人才。目前，学院有专兼职教师100多名，其中约45%的教师为外籍或在国外获得博士、硕士学位并可以原文讲课，约1/4的课程由原文讲授（英文或日文），85%以上的课程采用双语讲授。本院现有学生1800余名，其中硕士研究生超过1200名。
软件学院力求突破传统学科体系设置，严格遵照必须有巨大的市场需求、必须有领导性企业的支持合作、必须达到国内领先水平原则，设立了日文应用软件开发、集成电路设计、信息工程监理、高级IT项目管理与营销、计算机游戏设计、软件质量与测试、软件工程与管理以及信息安全等八个专业方向。其中日文应用软件开方向是教育部与中央电视台在北航众多专业中选择向社会推荐的两个专业之一，首批学生赴日实习就业率超过85%；集成电路设计方向率先与美国迈阿密佛罗里达州州立大学FIU合作办学，FIU教授来京全英文授课，学生可同时获得美国、中国认可的两个硕士学位。
为了真正培养出适合企业的实用型人才，也使企业与学院实现技术人才、产品研发等资源的最优共享，软件学院已与MICROSOFT、Hp、ORACLE、CISCO、VIA、NEC、富士通、理光、用友、联想集团、恒基伟业、北京市软件出口基地等数百家国内外软件企业签订了合作协议，为学生提供了从培养定位、专业实践到面向就业的全过程支持。2003级的学生中已有100多名被派往日本、加拿大、美国等海外软件企业实习就业，平均薪资远高于市场同类岗位薪资水平。
在软件工程本科课程体系设置上,学院改革基础课教学方式,增加启发式案例教学内容,加大外语应用能力培养力度,加强工程实践环节训练,按市场需求调整专业方向,使其反映计算机学科软件工程领域特点及发展趋势。高年级大部分专业课程采用双语教学(汉/英,汉/日)和原文教学(英、日语),使用优秀的原文教材,并和国外著名大学进行联合办学(现已与美国迈阿密佛罗里州州立大学FIU联合招收培养了一批中美双硕士)。软件学院已经成为了国内最国际化办学的学院之一,今后将陆续选派少部分优秀学生到加拿大、英国、美国、印度、爱尔兰、日本等地参加夏令营、冬令营或进行一、二学期的学生交换计划。
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